文章标题:食虫虻科线粒体基因组特征及系统发育分析
文章作者:闫文会** 李 虎*** 王怡帆 赵 瑞 吴 刚
关 键 词:食虫虻科;线粒体基因组;系统发育
文章摘要:
【目的】 食虫虻科Asilidae隶属双翅目Diptera短角亚目Brachycera,该科昆虫均为肉食性,成虫能捕食黄蜂、蝗虫、叶蝉、蚜蝇等昆虫,有助于保护生态系统的物种多样性。本研究旨在了解食虫虻科线粒体基因组特征及系统发育关系。【方法】 论文首次对已知的16种食虫虻线粒体基因组全序列进行了组学分析和系统发育讨论。【结果】 食虫虻科线粒体基因组具有22个tRNAs,13个蛋白质编码基因,2个rRNAs和1个控制区,基因排列顺序与亚库巴果蝇Drosophila
melanogaster一致,未发现基因重排现象;核苷酸组成分析表明AT含量远高于GC含量,具有明显的AT偏向性;atp6、atp8、cox2、cox3、cytb、nad2、nad3、nad4l和nad6 9个基因的起始密码子均为ATN,而cox1、nad1、nad4和nad5除了ATN以外,还有TCG和GTG,终止密码子则表现出高度的相似性,多为TAA、TAG和不完整的T和TA;相对同义密码子使用频率(Relative
synonymous codon usage)表明,亮氨酸Leu2的密码子UUA的使用频率最高,丙氨酸Ala的密码子GCG和苏氨酸Thr的密码子ACG的使用频率最低;13种蛋白质编码基因进化速率顺序为:atp8 > nad6 > nad4 > nad5 > nad2 > nad4l > nad1 > nad3 > atp6 > cox2 > cox3 > cytb > cox1。【结论】 基于PCGs数据集的系统发育证实了食虫虻科、食虫虻亚科、细腹虫虻亚科的单系性。这为深入了解食虫虻科昆虫的生物学特征、起源进化、系统发育关系提供了科学理论依据。