文章标题:意大利蜜蜂lncRNA17000的时空表达谱与潜在调控作用
文章作者:康 婧1** 任亚萍1** 叶道有1 王 宁1 陈 颖1 李峥源1 徐文华1 杨 雪1 陈大福1, 2, 3 邱剑丰1, 2, 3*** 郭 睿1, 2, 3***
关 键 词:意大利蜜蜂;长链非编码RNA;lncRNA17000;时空表达谱;调控作用
文章摘要:
【目的】 旨在探究lncRNA17000在意大利蜜蜂Apis mellifera
ligustica工蜂不同组织和发育阶段中的表达模式及其调控作用,为进一步的功能和机制研究提供基础。【方法】 通过RT-PCR验证lncRNA17000在工蜂不同组织中的表达。采用RT-qPCR检测其不同组织和发育阶段的相对表达量。利用LncTar、Miranda、RNAhybrid和TargetScan等一系列软件分析lncRNA17000的顺式、反式和竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA, ceRNA)调控作用。【结果】 在工蜂的脑、触角、毒腺、中肠、表皮、咽下腺和脂肪体7个组织中均扩增出符合预期大小(约133 bp)的目的片段。LncRNA17000在上述7个组织中差异表达,在触角中的表达量最高且显著高于(P<0.05)脂肪体中的表达量。LncRNA17000在工蜂的卵、幼虫、预蛹、蛹和成虫中差异表达,在7日龄预蛹中的表达量最高且显著高于(P<0.05)3日龄幼虫、8日龄预蛹和12日龄蛹中的表达量。LncRNA17000在6、12、15和18日龄成虫体内的表达量显著低于(P<0.05)1日龄成虫体内的表达量且表达水平随日龄增长而降低。LncRNA17000潜在调控7个上下游基因的转录和2个共表达基因的表达。LncRNA17000可靶向45个miRNA进而靶向66条mRNA,这些靶mRNA涉及23个GO条目和25条KEGG通路。【结论】 LncRNA17000在意大利蜜蜂工蜂的不同组织和发育阶段中动态差异表达,在触角和7日龄预蛹中特异性高表达;lncRNA17000可能通过顺式作用调控TFIID亚基11亚型X2基因转录,通过反式作用调控蜜蜂翼视蛋白基因表达,通过ceRNA网络靶向多个miRNA和mRNA进而影响胰岛素、ErbB和mTOR等信号通路。