《应用昆虫学报》

文章标题:西方蜜蜂泛素结合酶基因AmUBCD4的 生物信息学分析和表达模式测定

文章作者:吴伯文1** 臧 贺2, 3, 4** 刘彩珍1 冯睿蓉1 吴 杨1 付志英1 付中民2, 3, 4 郭 睿2, 3, 4***
关 键 词:西方蜜蜂;泛素结合酶E2-22 kD;生物信息学;结构域;表达模式
文章摘要:

目的 本研究对西方蜜蜂Apis mellifera泛素结合酶E2-22 kD(AmUBCD4)开展生物信息学解析,系统检测该基因在工蜂不同组织及发育阶段的表达特征,为深入探索其生物学功能提供理论基础。方法 使用相关生物信息学软件预测和分析AmUBCD4的理化性质、分子特性、二级结构、三级结构和蛋白互作网络,并进行西方蜜蜂和其他昆虫UBCD4的保守基序和结构域鉴定和比较。通过实时荧光定量PCR (RT-qPCR)鉴定AmUBCD4在西方蜜蜂工蜂脑、咽下腺、中肠、触角、毒腺、表皮和脂肪体各不同组织及卵、幼虫、预蛹和蛹各发育阶段的相对表达量。结果 AmUBCD4含199个氨基酸,分子式为C1010H1584N270O298S7,分子量约为22.50 kD,理论等电点为5.31,不稳定指数为45.22,半衰期为30 h,脂肪系数为88.29,平均亲水系数为﹣0.303。AmUBCD4含25个磷酸化位点,不含跨膜结构域和信号肽。AmUBCD4与Uba1和RpL40等10个蛋白构成1个互作网络。西方蜜蜂和其他9种昆虫的UBCD4均包含5个相同保守基序。西方蜜蜂、切叶蜂Megachile rotundata、金小蜂Nasonia vitripennis、造纸胡峰Polistes dominula、东方蜜蜂Apis cerana、欧洲熊蜂Bombus terrestris、小蜜蜂Apis florea和家蚕 Bombyx mori的UBCD4皆包含UBA_Ⅱ_E2_UBCD4和UBCc结构域。AmUBCD4在工蜂的触角、脑、中肠、毒腺、脂肪体、表皮和咽下腺中表现出差异表达。其中,表皮中的表达量最高,而中肠中的表达量最低。AmUBCD4的表达量在卵中最高,随后逐渐下降,至12日龄蛹时达到最低。结论 AmUBCD4可能是亲水蛋白和胞内蛋白,AmUBCD4在西方蜜蜂工蜂的表皮和咽下腺及卵和3日龄幼虫中特异性高表达。