文章标题:西瓜ClE2F/DP家族全基因组鉴定及其在瓜蚜胁迫下的表达模式分析
文章作者:陈黎明** 杨启帆 张千一 张爱环 张志勇 郭洪刚***
关 键 词:西瓜;E2F/DP转录因子;生物信息学;瓜蚜侵染;基因表达模式
文章摘要:
【目的】 探究西瓜Citrullus
lanatus ClE2F/DP基因家族对瓜蚜Aphis gossypii的抗蚜作用。【方法】 使用MEGA7、TBtools、MEME等对西瓜ClE2F/DP家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用qRT-PCR分析了瓜蚜取食前后西瓜ClE2F/DP基因的相对表达量。【结果】 共鉴定西瓜基因组中有6个ClE2F/DP成员,其中ClE2FA、ClE2FC为第一类不稳定亲水酸性蛋白,ClDP为第二类二聚蛋白,ClE2FE1为第三类不稳定亲水碱性蛋白,而且结合结构以及已有文献报道推测二聚蛋白ClDP及不稳定亲水碱性蛋白ClE2FEC、ClE2FE1可能参与植物抗病虫害过程。ClE2FA在蚜虫取食24 h后基因表达量上调2.5倍,ClE2FE1在蚜虫取食48 h后基因表达量先上调2.1倍,随后在取食72 h后表达量下调1.7倍;ClE2FC、ClDP在蚜虫取食24 h后显著下调超过2倍(P < 0.001),说明西瓜ClE2F/DP基因响应瓜蚜取食。【结论】 西瓜ClE2F/DP基因家族在响应蚜虫取食时存在显著的异质性。